أنشأت أكاديمية نادي الجزيرة بشكلها الحالي في الأول من يوليو من العام 2004، وهي الآن تمثل دليلا قويا ومؤشرا صادقا على اتجاه النادي للاستثمار الحقيقي في مستقبل كرة القدم، وفي أن يصبح النادي نموذجا تحتذي به كل الأندية الراغبة في استشراف المستقبل وتحقيق النجاح المستدام.
توفر الأكاديمية، التي يقع مبناها الرئيسي في منطقة الشوامخ، فرصة مثالية لتعليم متكامل للطلاب الصغار الموهوبين، ويعتبر تطوير القدرات الأكاديمية والرياضية لهؤلاء الموهوبين الصغار بمثابة الأولوية الأولى والأهم للنادي بوصفه ناديا قياديا ومحترفا بشكل كامل في الدولة والمنطقة بأسرها.
وبإنشاء تسعة مدارس ومراكز تكوين تابعة للأكاديمية في كل من بني ياس، الشهامة، إبن سينا، خليفة أ، المرفأ، الشوامخ، الوثبة، الباهية والفجيرة، يهدف النادي لضمان تطور سلس لكل المواهب الصغيرة بداية من التحاقها في سن صغيرة بالأكاديمية وانتهاء ببلوغها للفرق والمنتخبات الوطنية المختلفة، كما تعمل تلك الأفرع المنتشرة للأكاديمية في حمل رسالة النادي وإيصالها لكل المؤسسات الرياضية والمجتمعية في الدولة.
رؤية الأكاديمية هي تحويل اللاعبين الموهوبين الصغار إلى لاعبين ناضجين ومحترفين بشكل كامل وذلك بخلق ثقافة رياضية تشمل كل الإمارات. ورسالتها هي تثبيت أكاديمية نادي الجزيرة الرياضي بوصفها أحد الأكاديميات النخبوية التي تعمل دائما من أجل إيجاد ورعاية المواهب الواعدة في كل أنحاء الإمارات.
أما الهدف فهو تحقيق امتياز عالمي في الأداء الرياضي، من خلال خلق بيئة تعليمية ورياضية توفر العلوم الرياضية والتدريب والرعاية والدعم على أعلى المستويات العالمية، وأيضا تهدف لدمج الرياضة والألعاب بشكل كامل في الحياة اليومية في الإمارات.